Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PnnO35691 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PnnO35691 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PnnO35691 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PnnO35691 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PnnO35691 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PnnO35691 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PnnO35691 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PnnO35691 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnnO35691 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PnnO35691 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PnnO35691 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PnnO35691 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PnnO35691 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PnnO35691 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PnnO35691 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PnnO35691 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PnnO35691 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PnnO35691 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PnnO35691 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PnnO35691 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PnnO35691 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PnnO35691 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PnnO35691 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PnnO35691 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PnnO35691 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PnnO35691 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PnnO35691 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PnnO35691 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PnnO35691 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PnnO35691 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PnnO35691 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PnnO35691 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PnnO35691 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PnnO35691 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PnnO35691 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PnnO35691 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PnnO35691 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PnnO35691 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PnnO35691 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PnnO35691 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PnnO35691 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PnnO35691 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PnnO35691 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PnnO35691 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PnnO35691 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PnnO35691 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PnnO35691 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PnnO35691 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PnnO35691 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PnnO35691 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PnnO35691 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PnnO35691 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnnO35691 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnnO35691 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnnO35691 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnnO35691 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnnO35691 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnnO35691 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnnO35691 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnnO35691 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnnO35691 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PnnO35691 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PnnO35691 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PnnO35691 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PnnO35691 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PnnO35691 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PnnO35691 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PnnO35691 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PnnO35691 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PnnO35691 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PnnO35691 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PnnO35691 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PnnO35691 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PnnO35691 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PnnO35691 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PnnO35691 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PnnO35691 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PnnO35691 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PnnO35691 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PnnO35691 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PnnO35691 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PnnO35691 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PnnO35691 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PnnO35691 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PnnO35691 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PnnO35691 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms