Protein–RNA interactions for Protein: O35437

Tcf21, Transcription factor 21, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf21O35437 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf21O35437 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf21O35437 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms