Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Xbp1O35426 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xbp1O35426 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms