Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Abcc1O35379 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Abcc1O35379 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms