Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd2O35245 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkd2O35245 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms