Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArxO35085 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArxO35085 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArxO35085 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArxO35085 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArxO35085 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArxO35085 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArxO35085 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArxO35085 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArxO35085 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArxO35085 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArxO35085 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ArxO35085 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ArxO35085 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ArxO35085 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ArxO35085 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ArxO35085 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ArxO35085 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArxO35085 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArxO35085 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArxO35085 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArxO35085 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArxO35085 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArxO35085 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArxO35085 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArxO35085 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArxO35085 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArxO35085 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArxO35085 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArxO35085 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArxO35085 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArxO35085 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArxO35085 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArxO35085 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArxO35085 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArxO35085 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArxO35085 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArxO35085 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArxO35085 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArxO35085 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArxO35085 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArxO35085 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArxO35085 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArxO35085 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArxO35085 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArxO35085 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArxO35085 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArxO35085 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArxO35085 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArxO35085 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArxO35085 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArxO35085 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArxO35085 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ArxO35085 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArxO35085 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArxO35085 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArxO35085 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArxO35085 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ArxO35085 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ArxO35085 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ArxO35085 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ArxO35085 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArxO35085 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArxO35085 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArxO35085 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArxO35085 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ArxO35085 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArxO35085 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArxO35085 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArxO35085 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArxO35085 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArxO35085 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArxO35085 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArxO35085 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArxO35085 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ArxO35085 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ArxO35085 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ArxO35085 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ArxO35085 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ArxO35085 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ArxO35085 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ArxO35085 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ArxO35085 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ArxO35085 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms