Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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