Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms