Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CltaO08585 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CltaO08585 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CltaO08585 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CltaO08585 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CltaO08585 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CltaO08585 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CltaO08585 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CltaO08585 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CltaO08585 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CltaO08585 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CltaO08585 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CltaO08585 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CltaO08585 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CltaO08585 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CltaO08585 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CltaO08585 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CltaO08585 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CltaO08585 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CltaO08585 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CltaO08585 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CltaO08585 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CltaO08585 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CltaO08585 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CltaO08585 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CltaO08585 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CltaO08585 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CltaO08585 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CltaO08585 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CltaO08585 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CltaO08585 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CltaO08585 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CltaO08585 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CltaO08585 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CltaO08585 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CltaO08585 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CltaO08585 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CltaO08585 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CltaO08585 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CltaO08585 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CltaO08585 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CltaO08585 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltaO08585 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltaO08585 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltaO08585 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltaO08585 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CltaO08585 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltaO08585 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltaO08585 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltaO08585 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltaO08585 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltaO08585 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CltaO08585 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CltaO08585 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltaO08585 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltaO08585 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltaO08585 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltaO08585 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CltaO08585 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CltaO08585 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CltaO08585 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltaO08585 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltaO08585 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltaO08585 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CltaO08585 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CltaO08585 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CltaO08585 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CltaO08585 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms