Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp2O08574 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms