Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ32

A630076J17Rik, MCG1026332, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630076J17RikJ3QQ32 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms