Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3099J3QPA5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3099J3QPA5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms