Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21900J3QP38 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21900J3QP38 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms