Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21797J3QNW5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms