Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21798J3QNU5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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