Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim18J3QNP2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms