Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1134.8 ms