Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm21818J3KMS6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms