Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf4bG5E8Z2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms