Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms