Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf148G3X9R7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms