Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arid4aF8VPQ2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arid4aF8VPQ2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arid4aF8VPQ2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arid4aF8VPQ2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arid4aF8VPQ2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms