Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28048F7BCN0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms