Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21970F6XX07 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms