Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17093F6XGJ4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms