Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sptbn5F6UCX4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms