Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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BC067074F6RXI4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC067074F6RXI4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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BC067074F6RXI4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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BC067074F6RXI4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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BC067074F6RXI4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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BC067074F6RXI4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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BC067074F6RXI4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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BC067074F6RXI4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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BC067074F6RXI4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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BC067074F6RXI4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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BC067074F6RXI4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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BC067074F6RXI4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC067074F6RXI4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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