Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Rnf165E9QAU8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf165E9QAU8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf165E9QAU8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf165E9QAU8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf165E9QAU8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Rnf165E9QAU8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf165E9QAU8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rnf165E9QAU8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rnf165E9QAU8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Rnf165E9QAU8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Rnf165E9QAU8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf165E9QAU8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf165E9QAU8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf165E9QAU8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf165E9QAU8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf165E9QAU8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf165E9QAU8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Rnf165E9QAU8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Rnf165E9QAU8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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