Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lbE9Q9U0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lbE9Q9U0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp17lbE9Q9U0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp17lbE9Q9U0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp17lbE9Q9U0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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