Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Urb2E9Q7L1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Urb2E9Q7L1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms