Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7E4

Gm8882, Predicted gene 8882, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8882E9Q7E4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8882E9Q7E4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8882E9Q7E4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm8882E9Q7E4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8882E9Q7E4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8882E9Q7E4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms