Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Simc1E9Q6E9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms