Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms