Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms