Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tarbp1E9Q368 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms