Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt90E9Q1Z0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt90E9Q1Z0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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