Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm3893E9Q1I1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3893E9Q1I1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3893E9Q1I1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
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