Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Atad2bE9Q166 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Atad2bE9Q166 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Atad2bE9Q166 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Atad2bE9Q166 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Atad2bE9Q166 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms