Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm9972E9Q053 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms