Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fndc1E9Q043 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fndc1E9Q043 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms