Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ddx60E9PZQ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx60E9PZQ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx60E9PZQ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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