Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chd2E9PZM4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd2E9PZM4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms