Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc17E9PVB5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttc17E9PVB5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms