Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc175E9PVB3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc175E9PVB3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms