Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms