Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc6D3YZP9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms