Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms