Protein–RNA interactions for Protein: D2XZ31

Scgb1b29, ABPA7 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b29D2XZ31 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb1b29D2XZ31 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b29D2XZ31 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms