Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia4B8QI36 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia4B8QI36 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppfia4B8QI36 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia4B8QI36 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia4B8QI36 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia4B8QI36 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia4B8QI36 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia4B8QI36 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia4B8QI36 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia4B8QI36 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms