Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms